Programme des JTIF 2026

Programme prévisionnel sous réserve de modifications ultérieures

Mercredi 14 octobre 2026

8h45 - Accueil

Évolution des schémas de sélection

1. QualityTruite (FEP)  : Vers la fin des lots de collatéraux dérivés non sélectionnés ? - Jonathan D’Ambrosio, SYSAAF

2. CoBreeding (ANR) : Prise en compte des impacts environnementaux dans les objectifs de sélection de la filière truiticole française - Sophie de Montmorillon, INRAE

3. RESIGEN lot1 (France 2030) : Création d’un jumeau numérique de schéma de sélection : Apport de l’optimisation bayésienne pour la calibration des simulateurs sur les évolutions génétiques observées des lignées – Clovis Pawula, SYSAAF

4. RESIGEN lot1 : Évaluation par simulation stochastique des conséquences d’une reprise de la sélection depuis un cheptel satellite après perte totale des individus pedigree d’une lignée – Clovis Pawula, SYSAAF

5. Phacélie (Régions AURA et Bourgogne Franche-Comté) : Éléments pour la mise en œuvre de programmes de sélection en héliciculture - Michel Sourdioux et Soazig Le Damany, SYSAAF

Compréhension et amélioration de la résistance aux pathologies 

6. FlyPath (ANR) : Investigating viral and bacterial pathogens associated with black soldier fly (Hermetia illucens) larval mortality in a French industrial production facility - Caroline Wybraniec, IRBI

7. Première estimation de variabilité génétique additive de la résistance à la lactococcose chez la truite - Silvia Colussi (Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Piemonte, Liguria e Valle d'Aosta) - (visio) 

8. ShellFishBoost (Blue Economy) : Développement de la sélection génomique sur la palourde japonaise R. phillipinarum pour la résistance aux canicules marines et à Perkinsus - Antoine Jourdan, SYSAAF

9. FlavoResist (FEAMPA) : Modélisation épidémiologique de la flavobactériose pour l’identification de nouveaux critères de sélection chez la truite arc-en-ciel - Auguste Caen, INRAE

Caractérisation et gestion de la diversité génétique

10. AquaGris (FAO) : Recensement des ressources génétiques aquacoles françaises pour la FAO - Yas Farjas, DGAMPA et Anastasia Bestin, SYSAAF

11. Géronimo (UE) : Bilan et enseignements du suivi génétique in-situ d’une race locale de volailles, la Noire de Challans – Romuald Rouger, SYSAAF

12. Géronimo (UE) : Diversité épigénétique des races locales de poules – Carl Kroger, SYSAAF

13. RESIGEN lot 3 (France 2030) : Analyse génomique des structurations de populations de races locales – Romuald Rouger, SYSAAF

14. Définition d'un panel d'assignation à parenté et à population pour le saumon - Anastasia Bestin, SYSAAF

15. GenOut (Fonds Vert) : Développement de l’outil génomique outarde (suivi et gestion de diversité in-situ dans un contexte faune sauvage) – Romuald Rouger et Armel Donkpegan, SYSAAF

Nouvelles méthodes de phénotypage

16. GIS Avenir-Elevage : Caractériser et gérer la diversité génétique dans les filières de sélection animale - Simona Antonios, SYSAAF

17. RedOut (FEAMPA) : Quantification du muscle rouge par échographie chez la truite arc-en-ciel pour son intégration dans les objectifs de sélection - Florian Enez, SYSAAF

18. Géronimo (UE) : La variation de poids corporel : Un bon indicateur du poids de gras abdominal chez la poule pondeuse agée de 90 semaines – Alexandre Hubert ou Sandrine Lagarrigue, AgroCampusOuest

19. PouleBREAK (Carnot F2E) : Phénotypage par IA via photos de smartphones des déviations du Bréchet - Pauline Créach, ITAVI

20. SEPIAA (France 2030) : Phénotypage innovant en aquaculture - Mathieu Besson, SYSAAF

21. SEPIAA (France 2030) : Phénotypage de l’efficacité alimentaire individuelle chez les poissons : différentes approchez chez le bar – François Allal, IFREMER

22. BioSexFly (Région Centre Val-de-Loire) : Étude des mécanismes de sélection sexuelle chez la BSF – Armel Donkpegan, SYSAAF

23.  BioSexFly (Région Centre Val-de-Loire) : Bilan du programme de recherche, Christophe BRESSAC, IRBI

17h00 - Fin de la première journée

Jeudi 15 octobre 2026

8h45 - Accueil

Innovations en reproduction et biotechnologies

24. Velosperme : Sélection haploïde des spermatozoïdes de bar : une nouvelle voie – Marc Vandeputte, INRAE

25. RESIGEN lot 2 (France 2030) : Conservation longue durée de sperme de volaille – Léa Bravi, Landata

26. RESIGEN lot 2 (France 2030) : Étude de la relation donneur-hôte dans la transmission germinale des PGC - Firouzeh Sadeghzadeh, SYSAAF

27. RESIGEN lot 2 (France 2030) : Génération d’une lignée hôte par la technologie CRISPR pour faciliter la restauration génétique chez le poulet  - Antoine Clément, INRAE

Nouveaux modèles d’évaluation génétique 

28. Corrélations génétiques pour la longévité (ou la ponte) entre poules en cage, au sol et filles croisées - Lorry Bécot, Novogen

29. Hyperselect (FEAMPA) : Développement d'une matrice génomique d'apparentement en triploïdes chez la truite - Lou Buisson, INRAE

30. Utilisation du modèle COLONY en indexation génétique apicole - Jonathan d'Ambrosio, SYSAAF

La robustesse en aquaculture dans tous ses états

31. GoodVibe (FEAMPA) : Interaction Génotype x Environnement pour la mortalité estivale, la croissance et la morphologie chez l'huitre creuse C. gigas -  Soazig Le Damany, SYSAAF

32. SEPIAA (France 2030) : Optimiser le testage multi-environnements en utilisant des outils de simulation ». SEPIAA, Julien Roche, SYSAAF.

33. HyperSelect (FEAMPA) : Utilisation des modèles de régressions aléatoires pour intégrer les GxE dans les programmes de sélection, exemple sur le jeu de données Fishness ». Ewen Le Seyec, SYSAAF.

34. HyperSelect (FEAMPA) : Paramètres génétiques de la tolérance à l’hyperthermie en challenge contrôlé chez la truite - Yoannah François et Jonathan D'Ambrosio, SYSAAF.

Opportunités d’approches collectives 

35. Génotypage au SYSAAF : Négociation unique, partenariats et approche multi-espèce - Romain Morvezen, SYSAAF

36. Vers de nouveaux services d'optimisation des programmes de sélection par simulation au SYSAAF ? - TSIM, SYSAAF

37. Amélioration service informatique : Collecte et stockage des données - TIF, SYSAAF

Communication invitée :

38. Priorités de recherche en amélioration génétique : vision d’INRAE dans un contexte Européen - Marie-Hélène PINARD, INRAE

16h30 Conclusion générale et clôture